Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms