Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Snrpd1P62315 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Snrpd1P62315 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Snrpd1P62315 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Snrpd1P62315 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Snrpd1P62315 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Snrpd1P62315 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Snrpd1P62315 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Snrpd1P62315 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Snrpd1P62315 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Snrpd1P62315 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Snrpd1P62315 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Snrpd1P62315 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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