Protein–RNA interactions for Protein: P62192

Psmc1, 26S proteasome regulatory subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc1P62192 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmc1P62192 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmc1P62192 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmc1P62192 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmc1P62192 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmc1P62192 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmc1P62192 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmc1P62192 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmc1P62192 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmc1P62192 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmc1P62192 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmc1P62192 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psmc1P62192 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psmc1P62192 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psmc1P62192 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psmc1P62192 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psmc1P62192 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psmc1P62192 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psmc1P62192 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psmc1P62192 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psmc1P62192 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmc1P62192 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms