Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Vbp1P61759 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Vbp1P61759 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Vbp1P61759 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Vbp1P61759 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Vbp1P61759 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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