Protein–RNA interactions for Protein: P59110

Senp1, Sentrin-specific protease 1, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp1P59110 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Senp1P59110 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Senp1P59110 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Senp1P59110 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Senp1P59110 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Senp1P59110 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Senp1P59110 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms