Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms