Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lim2P56563 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lim2P56563 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lim2P56563 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lim2P56563 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lim2P56563 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lim2P56563 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lim2P56563 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lim2P56563 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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