Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms