Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Tmod1P49813 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
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Tmod1P49813 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Tmod1P49813 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Tmod1P49813 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Tmod1P49813 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Tmod1P49813 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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