Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Psen1P49769 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psen1P49769 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psen1P49769 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psen1P49769 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psen1P49769 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psen1P49769 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Psen1P49769 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psen1P49769 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psen1P49769 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Psen1P49769 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms