Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms