Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms