Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms