Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf1P46099 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf1P46099 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf1P46099 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf1P46099 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klf1P46099 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Klf1P46099 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf1P46099 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf1P46099 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf1P46099 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf1P46099 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf1P46099 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Klf1P46099 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf1P46099 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Klf1P46099 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klf1P46099 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf1P46099 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klf1P46099 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf1P46099 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klf1P46099 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf1P46099 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf1P46099 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf1P46099 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf1P46099 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf1P46099 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf1P46099 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf1P46099 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf1P46099 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf1P46099 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Klf1P46099 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms