Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PpargP37238 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PpargP37238 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PpargP37238 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PpargP37238 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PpargP37238 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PpargP37238 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PpargP37238 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PpargP37238 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PpargP37238 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PpargP37238 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PpargP37238 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PpargP37238 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PpargP37238 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PpargP37238 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PpargP37238 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PpargP37238 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PpargP37238 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PpargP37238 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PpargP37238 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PpargP37238 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PpargP37238 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PpargP37238 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PpargP37238 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PpargP37238 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PpargP37238 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PpargP37238 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PpargP37238 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PpargP37238 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PpargP37238 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PpargP37238 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PpargP37238 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PpargP37238 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PpargP37238 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PpargP37238 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PpargP37238 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PpargP37238 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PpargP37238 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PpargP37238 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PpargP37238 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PpargP37238 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PpargP37238 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PpargP37238 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PpargP37238 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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PpargP37238 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PpargP37238 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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PpargP37238 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PpargP37238 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PpargP37238 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PpargP37238 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PpargP37238 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PpargP37238 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PpargP37238 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PpargP37238 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PpargP37238 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PpargP37238 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PpargP37238 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PpargP37238 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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PpargP37238 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PpargP37238 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PpargP37238 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PpargP37238 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PpargP37238 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PpargP37238 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PpargP37238 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PpargP37238 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PpargP37238 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PpargP37238 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PpargP37238 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PpargP37238 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PpargP37238 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PpargP37238 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PpargP37238 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PpargP37238 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PpargP37238 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PpargP37238 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PpargP37238 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PpargP37238 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PpargP37238 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PpargP37238 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PpargP37238 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PpargP37238 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PpargP37238 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PpargP37238 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PpargP37238 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PpargP37238 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PpargP37238 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PpargP37238 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PpargP37238 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PpargP37238 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PpargP37238 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PpargP37238 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PpargP37238 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PpargP37238 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PpargP37238 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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