Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpardP35396 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpardP35396 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpardP35396 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpardP35396 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpardP35396 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpardP35396 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpardP35396 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpardP35396 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpardP35396 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpardP35396 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpardP35396 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpardP35396 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpardP35396 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpardP35396 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpardP35396 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpardP35396 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpardP35396 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpardP35396 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpardP35396 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpardP35396 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpardP35396 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpardP35396 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PpardP35396 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PpardP35396 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PpardP35396 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpardP35396 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpardP35396 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpardP35396 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpardP35396 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpardP35396 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpardP35396 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PpardP35396 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpardP35396 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpardP35396 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpardP35396 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpardP35396 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpardP35396 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpardP35396 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpardP35396 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpardP35396 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpardP35396 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PpardP35396 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PpardP35396 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PpardP35396 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PpardP35396 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PpardP35396 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpardP35396 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpardP35396 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpardP35396 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpardP35396 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpardP35396 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpardP35396 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpardP35396 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpardP35396 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpardP35396 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpardP35396 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpardP35396 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpardP35396 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpardP35396 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpardP35396 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpardP35396 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpardP35396 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpardP35396 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpardP35396 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpardP35396 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpardP35396 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpardP35396 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpardP35396 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpardP35396 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpardP35396 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpardP35396 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpardP35396 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpardP35396 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpardP35396 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpardP35396 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PpardP35396 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpardP35396 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpardP35396 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpardP35396 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpardP35396 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpardP35396 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpardP35396 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PpardP35396 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PpardP35396 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpardP35396 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpardP35396 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpardP35396 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpardP35396 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpardP35396 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpardP35396 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpardP35396 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpardP35396 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpardP35396 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpardP35396 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpardP35396 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpardP35396 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpardP35396 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpardP35396 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpardP35396 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms