Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms