Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms