Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VtnP29788 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VtnP29788 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VtnP29788 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VtnP29788 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VtnP29788 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VtnP29788 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VtnP29788 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
VtnP29788 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VtnP29788 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VtnP29788 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VtnP29788 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VtnP29788 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VtnP29788 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VtnP29788 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VtnP29788 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VtnP29788 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VtnP29788 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
VtnP29788 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VtnP29788 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VtnP29788 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VtnP29788 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VtnP29788 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VtnP29788 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VtnP29788 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VtnP29788 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VtnP29788 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VtnP29788 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VtnP29788 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VtnP29788 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VtnP29788 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
VtnP29788 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VtnP29788 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VtnP29788 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VtnP29788 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VtnP29788 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VtnP29788 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VtnP29788 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VtnP29788 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VtnP29788 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VtnP29788 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
VtnP29788 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VtnP29788 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VtnP29788 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VtnP29788 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VtnP29788 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VtnP29788 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VtnP29788 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VtnP29788 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VtnP29788 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VtnP29788 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VtnP29788 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VtnP29788 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VtnP29788 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VtnP29788 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VtnP29788 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VtnP29788 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VtnP29788 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VtnP29788 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
VtnP29788 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
VtnP29788 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
VtnP29788 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VtnP29788 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VtnP29788 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VtnP29788 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VtnP29788 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VtnP29788 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VtnP29788 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VtnP29788 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VtnP29788 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VtnP29788 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VtnP29788 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VtnP29788 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VtnP29788 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VtnP29788 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VtnP29788 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VtnP29788 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VtnP29788 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VtnP29788 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VtnP29788 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
VtnP29788 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VtnP29788 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VtnP29788 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VtnP29788 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
VtnP29788 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VtnP29788 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
VtnP29788 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VtnP29788 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VtnP29788 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VtnP29788 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VtnP29788 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VtnP29788 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VtnP29788 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VtnP29788 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VtnP29788 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VtnP29788 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VtnP29788 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VtnP29788 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VtnP29788 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VtnP29788 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms