Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxraP28700 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxraP28700 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxraP28700 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxraP28700 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxraP28700 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxraP28700 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxraP28700 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxraP28700 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxraP28700 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxraP28700 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxraP28700 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxraP28700 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxraP28700 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxraP28700 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxraP28700 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxraP28700 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RxraP28700 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RxraP28700 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxraP28700 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxraP28700 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxraP28700 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxraP28700 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxraP28700 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxraP28700 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxraP28700 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxraP28700 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxraP28700 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxraP28700 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxraP28700 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxraP28700 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxraP28700 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxraP28700 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxraP28700 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxraP28700 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxraP28700 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxraP28700 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxraP28700 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxraP28700 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxraP28700 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxraP28700 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxraP28700 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxraP28700 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxraP28700 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxraP28700 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxraP28700 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxraP28700 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxraP28700 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxraP28700 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxraP28700 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxraP28700 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxraP28700 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxraP28700 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RxraP28700 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxraP28700 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxraP28700 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxraP28700 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RxraP28700 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RxraP28700 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RxraP28700 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxraP28700 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxraP28700 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxraP28700 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RxraP28700 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxraP28700 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxraP28700 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxraP28700 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxraP28700 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxraP28700 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxraP28700 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxraP28700 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxraP28700 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxraP28700 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxraP28700 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxraP28700 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxraP28700 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxraP28700 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxraP28700 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxraP28700 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxraP28700 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxraP28700 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxraP28700 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxraP28700 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxraP28700 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxraP28700 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxraP28700 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RxraP28700 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxraP28700 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxraP28700 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RxraP28700 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RxraP28700 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxraP28700 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RxraP28700 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxraP28700 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxraP28700 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxraP28700 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxraP28700 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxraP28700 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxraP28700 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxraP28700 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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