Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PdgfraP26618 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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PdgfraP26618 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms