Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChgaP26339 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChgaP26339 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChgaP26339 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChgaP26339 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChgaP26339 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChgaP26339 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChgaP26339 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChgaP26339 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChgaP26339 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChgaP26339 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms