Protein–RNA interactions for Protein: P23475

Xrcc6, X-ray repair cross-complementing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc6P23475 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Xrcc6P23475 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms