Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RarbP22605 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RarbP22605 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RarbP22605 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RarbP22605 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RarbP22605 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RarbP22605 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RarbP22605 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RarbP22605 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RarbP22605 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RarbP22605 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RarbP22605 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RarbP22605 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RarbP22605 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RarbP22605 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RarbP22605 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RarbP22605 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RarbP22605 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RarbP22605 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RarbP22605 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RarbP22605 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RarbP22605 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RarbP22605 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RarbP22605 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RarbP22605 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RarbP22605 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RarbP22605 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RarbP22605 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RarbP22605 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RarbP22605 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RarbP22605 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RarbP22605 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RarbP22605 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RarbP22605 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RarbP22605 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RarbP22605 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RarbP22605 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RarbP22605 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RarbP22605 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RarbP22605 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RarbP22605 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RarbP22605 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RarbP22605 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RarbP22605 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RarbP22605 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RarbP22605 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RarbP22605 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RarbP22605 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RarbP22605 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RarbP22605 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RarbP22605 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RarbP22605 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RarbP22605 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RarbP22605 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RarbP22605 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RarbP22605 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RarbP22605 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RarbP22605 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RarbP22605 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RarbP22605 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RarbP22605 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RarbP22605 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RarbP22605 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RarbP22605 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RarbP22605 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RarbP22605 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RarbP22605 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RarbP22605 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RarbP22605 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RarbP22605 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RarbP22605 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RarbP22605 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RarbP22605 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RarbP22605 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RarbP22605 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RarbP22605 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RarbP22605 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RarbP22605 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RarbP22605 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RarbP22605 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RarbP22605 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RarbP22605 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RarbP22605 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RarbP22605 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RarbP22605 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RarbP22605 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RarbP22605 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RarbP22605 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RarbP22605 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RarbP22605 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RarbP22605 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RarbP22605 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RarbP22605 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RarbP22605 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RarbP22605 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RarbP22605 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RarbP22605 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RarbP22605 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RarbP22605 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RarbP22605 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms