Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms