Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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