Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NefhP19246 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NefhP19246 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NefhP19246 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NefhP19246 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NefhP19246 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NefhP19246 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NefhP19246 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NefhP19246 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NefhP19246 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NefhP19246 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NefhP19246 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NefhP19246 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NefhP19246 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NefhP19246 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NefhP19246 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NefhP19246 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NefhP19246 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NefhP19246 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NefhP19246 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NefhP19246 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NefhP19246 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NefhP19246 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NefhP19246 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NefhP19246 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NefhP19246 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NefhP19246 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NefhP19246 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NefhP19246 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NefhP19246 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NefhP19246 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NefhP19246 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NefhP19246 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NefhP19246 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NefhP19246 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NefhP19246 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NefhP19246 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NefhP19246 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NefhP19246 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NefhP19246 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NefhP19246 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NefhP19246 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NefhP19246 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NefhP19246 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NefhP19246 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NefhP19246 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NefhP19246 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NefhP19246 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NefhP19246 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NefhP19246 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NefhP19246 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NefhP19246 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NefhP19246 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NefhP19246 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NefhP19246 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NefhP19246 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NefhP19246 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NefhP19246 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NefhP19246 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NefhP19246 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NefhP19246 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NefhP19246 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NefhP19246 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NefhP19246 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NefhP19246 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NefhP19246 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NefhP19246 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NefhP19246 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NefhP19246 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NefhP19246 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
NefhP19246 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
NefhP19246 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NefhP19246 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NefhP19246 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NefhP19246 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NefhP19246 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NefhP19246 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NefhP19246 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NefhP19246 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NefhP19246 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NefhP19246 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NefhP19246 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NefhP19246 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NefhP19246 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NefhP19246 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NefhP19246 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NefhP19246 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NefhP19246 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NefhP19246 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NefhP19246 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NefhP19246 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NefhP19246 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NefhP19246 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NefhP19246 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NefhP19246 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NefhP19246 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NefhP19246 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NefhP19246 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NefhP19246 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NefhP19246 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms