Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms