Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18528 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18528 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18528 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18528 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P18528 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18528 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18528 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18528 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18528 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18528 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18528 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18528 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18528 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18528 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18528 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18528 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18528 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18528 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18528 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18528 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18528 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18528 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18528 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18528 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18528 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18528 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18528 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18528 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18528 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18528 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18528 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18528 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P18528 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18528 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18528 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18528 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P18528 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P18528 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P18528 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18528 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18528 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18528 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18528 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18528 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P18528 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P18528 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18528 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18528 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18528 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18528 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18528 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18528 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18528 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18528 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P18528 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18528 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18528 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18528 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18528 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18528 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18528 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18528 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18528 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18528 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18528 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P18528 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18528 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18528 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18528 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18528 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18528 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18528 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18528 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18528 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18528 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18528 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18528 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18528 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P18528 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18528 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18528 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P18528 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18528 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18528 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P18528 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18528 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P18528 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P18528 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18528 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18528 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18528 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18528 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18528 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18528 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18528 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18528 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18528 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18528 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18528 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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