Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms