Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DmdP11531 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DmdP11531 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DmdP11531 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DmdP11531 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DmdP11531 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DmdP11531 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DmdP11531 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DmdP11531 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
DmdP11531 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DmdP11531 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DmdP11531 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DmdP11531 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DmdP11531 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DmdP11531 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DmdP11531 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DmdP11531 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DmdP11531 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DmdP11531 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DmdP11531 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DmdP11531 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DmdP11531 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DmdP11531 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DmdP11531 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DmdP11531 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DmdP11531 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DmdP11531 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DmdP11531 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DmdP11531 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DmdP11531 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DmdP11531 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DmdP11531 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DmdP11531 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DmdP11531 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DmdP11531 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DmdP11531 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DmdP11531 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DmdP11531 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DmdP11531 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DmdP11531 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DmdP11531 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DmdP11531 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DmdP11531 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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DmdP11531 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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DmdP11531 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DmdP11531 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DmdP11531 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DmdP11531 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DmdP11531 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DmdP11531 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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DmdP11531 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DmdP11531 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DmdP11531 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DmdP11531 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DmdP11531 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DmdP11531 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DmdP11531 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.19
DmdP11531 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
DmdP11531 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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DmdP11531 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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DmdP11531 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DmdP11531 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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DmdP11531 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DmdP11531 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DmdP11531 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DmdP11531 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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DmdP11531 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DmdP11531 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DmdP11531 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DmdP11531 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DmdP11531 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DmdP11531 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DmdP11531 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DmdP11531 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DmdP11531 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DmdP11531 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DmdP11531 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DmdP11531 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DmdP11531 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DmdP11531 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DmdP11531 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DmdP11531 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
DmdP11531 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DmdP11531 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DmdP11531 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DmdP11531 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
DmdP11531 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms