Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa1P11477 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa1P11477 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa1P11477 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Defa1P11477 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa1P11477 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa1P11477 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa1P11477 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms