Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms