Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms