Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms