Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spta1P08032 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spta1P08032 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spta1P08032 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spta1P08032 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spta1P08032 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spta1P08032 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spta1P08032 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spta1P08032 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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