Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TtrP07309 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TtrP07309 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TtrP07309 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TtrP07309 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
TtrP07309 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TtrP07309 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TtrP07309 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TtrP07309 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TtrP07309 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TtrP07309 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TtrP07309 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TtrP07309 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TtrP07309 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TtrP07309 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TtrP07309 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TtrP07309 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TtrP07309 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TtrP07309 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TtrP07309 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TtrP07309 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
TtrP07309 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TtrP07309 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TtrP07309 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TtrP07309 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
TtrP07309 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TtrP07309 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TtrP07309 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TtrP07309 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TtrP07309 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TtrP07309 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TtrP07309 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TtrP07309 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TtrP07309 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TtrP07309 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TtrP07309 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TtrP07309 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TtrP07309 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TtrP07309 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TtrP07309 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TtrP07309 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TtrP07309 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TtrP07309 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TtrP07309 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TtrP07309 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TtrP07309 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TtrP07309 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TtrP07309 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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TtrP07309 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TtrP07309 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TtrP07309 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TtrP07309 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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TtrP07309 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TtrP07309 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TtrP07309 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TtrP07309 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TtrP07309 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TtrP07309 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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TtrP07309 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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TtrP07309 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TtrP07309 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TtrP07309 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TtrP07309 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TtrP07309 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TtrP07309 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TtrP07309 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TtrP07309 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TtrP07309 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TtrP07309 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TtrP07309 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TtrP07309 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TtrP07309 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TtrP07309 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TtrP07309 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TtrP07309 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TtrP07309 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TtrP07309 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TtrP07309 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TtrP07309 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TtrP07309 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TtrP07309 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TtrP07309 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TtrP07309 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TtrP07309 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TtrP07309 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TtrP07309 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TtrP07309 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TtrP07309 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TtrP07309 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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