Protein–RNA interactions for Protein: P06795

Abcb1b, Multidrug resistance protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1bP06795 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms