Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P06323 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P06323 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P06323 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P06323 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P06323 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P06323 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P06323 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P06323 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P06323 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P06323 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P06323 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P06323 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P06323 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P06323 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P06323 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P06323 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P06323 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P06323 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P06323 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P06323 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P06323 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P06323 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P06323 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P06323 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P06323 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P06323 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P06323 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P06323 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P06323 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P06323 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P06323 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
P06323 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
P06323 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P06323 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P06323 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P06323 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
P06323 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P06323 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P06323 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P06323 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P06323 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P06323 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P06323 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P06323 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P06323 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P06323 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P06323 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P06323 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P06323 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P06323 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P06323 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P06323 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
P06323 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P06323 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P06323 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P06323 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P06323 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P06323 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P06323 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P06323 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P06323 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P06323 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P06323 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P06323 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P06323 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P06323 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P06323 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P06323 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P06323 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
P06323 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P06323 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P06323 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P06323 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P06323 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P06323 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P06323 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
P06323 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P06323 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P06323 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P06323 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P06323 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
P06323 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P06323 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P06323 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P06323 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P06323 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P06323 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P06323 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P06323 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P06323 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P06323 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P06323 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P06323 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P06323 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P06323 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P06323 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P06323 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P06323 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P06323 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms