Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms