Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01641 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01641 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01641 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01641 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01641 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01641 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01641 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01641 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01641 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01641 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01641 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01641 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01641 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01641 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01641 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01641 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P01641 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01641 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01641 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P01641 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01641 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P01641 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01641 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01641 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01641 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01641 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01641 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01641 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01641 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01641 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01641 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01641 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01641 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P01641 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01641 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01641 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
P01641 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01641 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01641 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01641 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01641 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01641 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01641 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01641 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01641 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01641 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01641 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01641 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01641 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01641 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01641 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01641 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01641 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01641 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01641 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01641 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01641 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01641 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01641 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01641 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01641 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01641 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01641 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01641 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01641 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01641 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01641 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01641 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01641 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01641 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01641 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01641 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01641 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01641 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01641 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01641 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01641 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01641 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01641 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01641 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01641 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01641 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01641 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01641 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P01641 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P01641 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P01641 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P01641 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01641 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01641 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01641 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01641 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01641 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01641 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01641 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01641 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P01641 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01641 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01641 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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