Protein–RNA interactions for Protein: O89033

Cdc6, Cell division control protein 6 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc6O89033 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc6O89033 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms