Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms