Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SfnO70456 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SfnO70456 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SfnO70456 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SfnO70456 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SfnO70456 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SfnO70456 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SfnO70456 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SfnO70456 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SfnO70456 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SfnO70456 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SfnO70456 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SfnO70456 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SfnO70456 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SfnO70456 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SfnO70456 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SfnO70456 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SfnO70456 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SfnO70456 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SfnO70456 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SfnO70456 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SfnO70456 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SfnO70456 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SfnO70456 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SfnO70456 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SfnO70456 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SfnO70456 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SfnO70456 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SfnO70456 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SfnO70456 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SfnO70456 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SfnO70456 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SfnO70456 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SfnO70456 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SfnO70456 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SfnO70456 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SfnO70456 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SfnO70456 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SfnO70456 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SfnO70456 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SfnO70456 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SfnO70456 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SfnO70456 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SfnO70456 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SfnO70456 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SfnO70456 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SfnO70456 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SfnO70456 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SfnO70456 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SfnO70456 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SfnO70456 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SfnO70456 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SfnO70456 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SfnO70456 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SfnO70456 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SfnO70456 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SfnO70456 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SfnO70456 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SfnO70456 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SfnO70456 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SfnO70456 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SfnO70456 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SfnO70456 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SfnO70456 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SfnO70456 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SfnO70456 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SfnO70456 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SfnO70456 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SfnO70456 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SfnO70456 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SfnO70456 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SfnO70456 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SfnO70456 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SfnO70456 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SfnO70456 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SfnO70456 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SfnO70456 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SfnO70456 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SfnO70456 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SfnO70456 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SfnO70456 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SfnO70456 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SfnO70456 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SfnO70456 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SfnO70456 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SfnO70456 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SfnO70456 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SfnO70456 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SfnO70456 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SfnO70456 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SfnO70456 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SfnO70456 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SfnO70456 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SfnO70456 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SfnO70456 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SfnO70456 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SfnO70456 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SfnO70456 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SfnO70456 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SfnO70456 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms