Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms