Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms