Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms