Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema6bO54951 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema6bO54951 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema6bO54951 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema6bO54951 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema6bO54951 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema6bO54951 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema6bO54951 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema6bO54951 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema6bO54951 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema6bO54951 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema6bO54951 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema6bO54951 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema6bO54951 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema6bO54951 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema6bO54951 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema6bO54951 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema6bO54951 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema6bO54951 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema6bO54951 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema6bO54951 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema6bO54951 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema6bO54951 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema6bO54951 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema6bO54951 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema6bO54951 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema6bO54951 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema6bO54951 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema6bO54951 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema6bO54951 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema6bO54951 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema6bO54951 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema6bO54951 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema6bO54951 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema6bO54951 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema6bO54951 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema6bO54951 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema6bO54951 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema6bO54951 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema6bO54951 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema6bO54951 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema6bO54951 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema6bO54951 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema6bO54951 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sema6bO54951 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sema6bO54951 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sema6bO54951 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Sema6bO54951 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sema6bO54951 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sema6bO54951 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sema6bO54951 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sema6bO54951 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sema6bO54951 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms