Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms