Protein–RNA interactions for Protein: O54851

Gjd2, Gap junction delta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd2O54851 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms